**TI82** TxtView file generated by CalcText - Kouriª›Mvocabul›™ÿAnalyse phylo vocabulairNON RACINE : pas de sens historique OTU : Operational Taxonomic Unit Distance patristique = calculée sur arbre HOMOLOGUES : caractères/sites/structures qui dérivent d’une structure/carac/site issu d’un ancêtre commun ORTHOLOGUES : séquences qui ont acquises leur autonomie évolutive après un évènement de spéciation. ALIGNEMENT : consiste à disposer les unes sous les autres les séquences homologues en minimisant les différences SITE CONSERVÉ : sites présentant le même état pour chacun des sites concernés SUBSTITUTION : changement d’état dans un site. 2 types PAS équiprobables (math): TRANSVERSIONS(échange base pur > base pyr) ++ // - TRANSITIONS(échange entre bases pyr ou entre pur) MAIS réalité = inverse car Transition mieux toléré Spéciation//Transfert horizontal Plésiomorphie : état ancestral d’un caractère Apomorphie : état dérivé d’état ancestral ou intermédiaire (=du nouveau) Synapomorphie :état dérivé partagé par au moins 2 taxons Symplésiomorphie :partage de l’état ancestral Autapomorphie :apomorphie restrainte à un taxon Groupe monophylétique (=clade) :origine unique avec Tous ancêtres communs et descendants (ex : mammifères)(synapomorphie) Groupe paraphylétique : a 1 seul ancètre commun et pas tous descendants (ex : reptiles, où ont besoin oiseaux pour être complets)(symplésiomorphie) Groupe polyphylétique : plusieurs ancètres communs : HOMOPLASIE = bruit génétique Sister group ou groupe frère :groupes avc ancètre commun proche (ex : A-B) Critère ontogénique : +1 état apparait tard dans développement, + sera spécialisé (=apomorphe) // + tot = sera ancestral (=plésiomorphe). ÿOs